条形码的筛选（SW-CJ-1FD应用）

１ 材料与方法

超净工作台（ＳＷ－ＣＪ－１ＦＤ），上海博实业有限公司医疗设备厂产 品；凝 胶 成 像 仪 （ＧｅｌＤｏｃＸＲ）、梯 度 ＰＣＲ 仪（Ｔ１００），美 国 Ｂｉｏ－Ｒａｄ 公司产品；高速离心机（ＪＷ－２０１７Ｈ），安徽嘉文仪器 装备有限公司产品；超低温冰箱（ＤＷ－ＨＬ３２８），中科 美菱低温 科 技 有 限 责 任 公 司 产 品；恒 温 摇 床（ＨＺ－ ２０１１ＫＡ），太仓市华利达实验设备有限公司产品；电 泳仪（ＤＹＹ－６Ｃ），北京市六一仪器厂产品。

２ 结果

本试验对３个候选的 ＤＮＡ 条形码片段ｃｐｎ６０、 ｒｅｃＡ 和ｐｐｓＡ 进行 ＰＣＲ 扩增和琼脂 糖 凝 胶 电 泳 检 测。候 选 基 因 的 长 度 在５３０ｂｐ～１０６５ｂｐ。 其中ｒｅｃＡ 序 列 最 长，约 为１０６５ｂｐ；ｐｐｓＡ 序 列 最 短，长度约为５３０ｂｐ；ｃｐｎ６０序列长度约为５５５ｂｐ。 ＧＣ含量 ｐｐｓＡ 基 因 最 高，为 ６５％；其 次 是ｒｅｃＡ 和 ｃｐｎ６０，分别为５９．１％和５７．２％。序列变异位点数可 反 映 序 列 的 变 异 程 度，ｃｐｎ６０ 变 异 位 点 数 最 多 （１４７）；变异位点占总长度的比例也最高（２７．６８％）， 显 著 高 于 ｒｅｃＡ（１２．４２％）和 ｐｐｓＡ（２．３％），提 示 ｃｐｎ６０基因可 为 物 种 提 供 更 多 的 鉴 别 信 息。此 外， ｃｐｎ６０基 因 的 ＰＣＲ 扩增测序成功率也是 最高的 （７５．８％），更容易获得。

免责声明：文章仅供学习和交流，如涉及作品版权问题需要我方删除，请联系我们，我们会在第一时间进行处理。